Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOPBP1Q92547 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOPBP1Q92547 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms