Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SVOPQ8N4V2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms