Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TXNDC2Q86VQ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TXNDC2Q86VQ3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms