Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EDC4Q6P2E9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EDC4Q6P2E9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms