Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPH2Q6IBW4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms