Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USPL1Q5W0Q7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
USPL1Q5W0Q7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms