Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STRIP1Q5VSL9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STRIP1Q5VSL9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms