Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q5VSD8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms