Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FRMPD1Q5SYB0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms