Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SDK2Q58EX2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SDK2Q58EX2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms