Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CERKLQ49MI3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CERKLQ49MI3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms