Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF3Q3KNV8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms