Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NBPF8Q3BBV2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms