Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA6Q16445 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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