Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZIC1Q15915 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZIC1Q15915 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms