Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS72Q15906 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS72Q15906 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
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