Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CACNA1EQ15878 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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