Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITSN1Q15811 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITSN1Q15811 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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