Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCOA1Q15788 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
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NCOA1Q15788 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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NCOA1Q15788 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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NCOA1Q15788 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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NCOA1Q15788 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
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NCOA1Q15788 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
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NCOA1Q15788 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCOA1Q15788 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
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