Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TAF1CQ15572 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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