Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RSU1Q15404 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RSU1Q15404 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms