Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF1Q15361 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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