Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHPRHQ149N8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHPRHQ149N8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
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