Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCARF1Q14162 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCARF1Q14162 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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