Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA7Q13683 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms