Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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