Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD3Q0VAK6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LMOD3Q0VAK6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms