Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC3A1Q07837 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms