Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRTAP1-1Q07627 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms