Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
UBE3AQ05086 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
UBE3AQ05086 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms