Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC004816.1-202ENST00000557691 629 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CFLAR-212ENST00000440180 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 C1orf146-202ENST00000370375 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB1Q02641 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms