Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms