Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IRX3P78415 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IRX3P78415 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IRX3P78415 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IRX3P78415 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms