Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTF2IP78347 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2IP78347 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms