Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ACTA2P62736 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms