Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ERVS71-1P61550 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms