Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms