Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP107P57740 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP107P57740 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP107P57740 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP107P57740 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP107P57740 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP107P57740 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms