Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIPPLY3P57055 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms