Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ4P56696 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNQ4P56696 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms