Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC13P55735 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC13P55735 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC13P55735 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC13P55735 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC13P55735 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC13P55735 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC13P55735 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC13P55735 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC13P55735 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC13P55735 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC13P55735 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms