Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAB5CP51148 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RAB5CP51148 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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