Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI2P48788 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms