Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DCCP43146 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DCCP43146 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DCCP43146 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCCP43146 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCCP43146 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCCP43146 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DCCP43146 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DCCP43146 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DCCP43146 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DCCP43146 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms