Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TNFSF9P41273 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms