Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP6P35125 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP6P35125 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP6P35125 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP6P35125 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP6P35125 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP6P35125 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.5 ms