Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 LINC00958-201ENST00000504230 1558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HOXD11P31277 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PROCR-201ENST00000216968 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC011290.1-201ENST00000439751 414 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TPT1P10-201ENST00000312966 496 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC004231.1-201ENST00000418393 815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 LLPH-202ENST00000446587 1177 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC110800.1-201ENST00000505498 441 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AL136304.1-201ENST00000607790 509 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HOXD11P31277 CASC20-201ENST00000415932 1484 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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