Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXA11P31270 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms