Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CASP1P29466 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms