Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CTSSP25774 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTSSP25774 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTSSP25774 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms